2004年是球队动荡申花上海海港主教练宣布辞职，球队陷入动荡的一年申花上海海港主教练宣布辞职，球队陷入动荡，年初因为原球队主教练吴金贵出任国家队助理教练，威尔金森在履行完3个月的工作合同后离开申花，助理教练贾秀全10月告别申花，俱乐部又找来的俄罗斯教练涅波出任主教练，原主教练吴金贵也回到申花出任俱乐部副总经理2005 在经过申花上海海港主教练宣布辞职，球队陷入动荡了赛季间歇期的调整后，涅波逐渐将自己的执教思路灌输到球队之中，2005赛季。
现山东鲁能泰山足球队主教练 获得欧足联官方评出的欧洲最伟大的主教练之一，2006年荣获塞尔维亚年度最佳教练1952年9月2日生于前南斯拉夫贝尔格莱德，毕业于贝尔格莱德体育运动学院1979年至1990年，先后执教前南斯拉夫贝尔格莱德亚尼斯奇奥比利奇及科威特科丹队1990年至1999年任贝尔格莱德游击队青年队和一。
2003年，上海申花再度加冕甲A冠军，然而2013年足协认定申花当赛季涉嫌假球，剥夺了申花的末代甲A冠军头衔 进入中超时代以来，尽管申花也曾动荡过，甚至一度到了外迁云南的边缘，但都在球迷们的坚定支持下化险为夷，保住了上海申花这块金字招牌只可惜美中不足的是，申花征战中超至今，迟迟没能染指联赛冠军，仅在2017和2019。
2007年，卢欣得到了去上海发展的机会，在恩师吉梅内斯的邀请下，他188金宝博再次以租借身份加盟上海联城，后来合并后的申花队，卢欣成为新申花一员，代表球队参加了亚冠和A3联赛在好友王军退役后不久，34岁的卢欣也宣布结束他十多年的绿茵生涯，结束了这段异乡漂泊的生活。
细究俱乐部扎堆换帅，不外几个原因一是球队成绩确实糟糕，不换帅相当于束手就擒，比如天津亿利队帕切科和江苏苏宁队崔龙洙二是俱乐部和教练希望换换运气，比如河南建业队主教练贾秀全三是虽然球队排名尚可，但俱乐部和球迷要求较高，对于战术打法一盘散沙模样的球队极为不满，主教练只能引咎辞职，比如。
在主场对上海申花的比赛错穿球衣因而被中国足协倒扣联赛积分3分的不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级2010年2月19日，深圳红钻足球俱乐部宣布，拥有塞尔维亚和塞浦路斯双重国籍前贝尔格莱德红星队主教练高歌奇Sinisa Gogic在2月18日与红钻俱乐部在深圳正式签约，成为深足的主教练加上。
高洪波，男，笔名向川，诗人散文家，1951年12月生于内蒙古1988年毕业于北京大学中文系1971年开始发表作品1984年加入中国作家协会1978年转业后历任文艺报新闻部副主任，中国作家协会办公厅副主任，中国作家副主编，诗刊主编，中国作家协会创联部主任书记处书记中国作家协会第九届。
当年以及第二年，球队均保级成功2000赛季，获全国足球甲A联赛第九名2001赛季，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，从此深圳足球队成为了中国足球联赛的强队之一2002赛季，球队获得了联赛半程冠军，是继大连实德上海申花后第三支获得过联赛半程冠军的球队，并最终获得联赛亚军2003赛季。
深圳队在联赛间歇期从上海申花打包租借了毛剑卿巴尔克斯陈雷三名球员，并签约曾效力天津泰达被誉为津门铁卫的佐里奇，实力获得很大提升在主场对上海申花的比赛错穿球衣因而被中国足协倒扣联赛积分3分的不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级2010年，前贝尔格莱德红星队主教练高歌奇与。
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